能推荐几个R语言与药学相关的常用包吗?

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徐燕 - Technical support&Sales 2017-10-11 回答

R包的使用跟行业关联不大。。
 
经常用的包如下 分析与建模:
Matrix包:先进的稀疏矩阵处理,不了解稀疏矩阵概念的时候内存占用和运行速度都不忍直视。
Reshape2/ddply:数据处理不用愁。
*apply系列:比for更好用的函数,其中tapply远不如lapply流行,但是实用程度不在其下。实际上lapply有没有变快得看各人的实现,因为虽然lapply调用了C实现,但是它还是要回头调用在R里用户定义的函数才能做计算,这个函数速度如何才是关键。
compiler包:即使代码里有for也可以加速。
foreach:通用的并行接口,跨平台多功能。
lubridate:处理时间日期格式不求人。
gbm:效果和randomForest相近,但是占用内存很少很幸福,而且支持多核 CrossValidation 运算。
stats::optim():做优化的最傻瓜选择。不信看这个三行R代码做出SVM:weibo.com/1459604443/A3,不懂牛顿法也没关系。
报告与可视化:knitr/slidify:knitr是 @谢益辉 的代表作。做报告、幻灯片 so easy,但是slidify的作者不喜欢写文档,所以很头疼。
shiny:用R生成Web App,后端强劲接口统一。例如:hetong.shinyapps.io/img 。
recharts:在R中方便快捷地生成可交互图形,再也不用从R换到js了。
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roddicki 2017-10-13 回答

看你具体做什么了,https://cran.r-project.org/web ... .html,这是药物动力学和药代动力学分析的一些包。

如果是临床试验,也有相应的view。

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