请教一下，在heatmap的时候如何对行进行排序

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2016-10-18 添加评论
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    marxsong 2016-10-18 回答

    通过调整heatmap函数的Rowv和Colv 参数值来重新设置排序
     
    示例如下：
    set.seed(123)
    x <- rnorm(10)
    m <- dist(x)
    hc <- hclust(m)

    dd <- as.dendrogram(hc)
    plot(dd, main = "random dendrogram 'dd'")

    123.png


    heatmap(as.matrix(m))

    1234.png



    dd.reorder <- reorder(dd, 10:1, agglo.FUN = mean)
    plot(dd.reorder, main = "reorder(dd, 10:1, mean)")

    12345.png


    heatmap(as.matrix(m),Colv=dd.reorder,Rowv=dd.reorder)

    123456.png

     
     
     
     
    2016-10-18 0
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