统计图形的配色，对于缺乏色感的人来说，可能是一个比较头疼的问题。翻来覆去，改了又改，但是最终可能都拿不定注意采用那套方案。采用统计软件默认的配色方案吧，如果是SAS(我觉得很多人也不愿去用SAS去绘图），估计内心是奔溃的。R软件里大名鼎鼎的ggplot2的配色，确实为大众所喜欢。这里，除了ggplot2，我尝试倒腾了下两个好玩的R包，给大家分享下。
1. ggtech
参考官网：https://github.com/ricardo-bion/ggtech
官网上提供了示例代码，不过在尝试之前，建议先安装好devtools和curl两个包，然后可以从github上安装最新版的ggplot2和ggtech。
准备工作：
install.packages("devtools")
install.packages("curl")
devtools::install_github('hadley/ggplot2')
devtools::install_github("ricardo-bion/ggtech", dependencies=TRUE)
library(ggplot2)
library(ggtech)
ggtech是新版ggplot2的科技主题包，打包了Airbnb，Etsy，Facebook，Google以及Twitter等科技公司的主题配色。比如Airbnb主题：
示例代码：
d <- qplot(carat, data = diamonds[diamonds$color %in%LETTERS[4:7], ], geom = "histogram", bins=30, fill = color)
d + theme_tech(theme="airbnb") +
scale_fill_tech(theme="airbnb") +
labs(title="Airbnb theme", subtitle="now with subtitles for ggplot2 >= 2.1.0")
其他主题配色图：
具体代码可见官网：https://github.com/ricardo-bion/ggtech
ggplot2的颜色配置很亮丽，ggtech的配色也很有科技感，不过对于科研人员来讲，更感兴趣的可能并不是科技公司的配色，而是科研期刊的配色。ggsci就专门针对SCI科研期刊图形的配色，做了一些打包处理。
2. ggsci
参考官网：https://cran.r-project.org/web/packages/ggsci/vignettes/ggsci.html
ggsci打包了Nature Publishing Group，American Association for the Advancement of Science，Lancet journals等期刊的图片配色，具体如下图：
不过对于医药领域，比较实用的可能是Lancet的配色：
代码：
准备工作：
install.packages("gridExtra")
install.packages("ggsci")
library("ggsci")
library("gridExtra")
图形准备：
data("diamonds")
p1 = ggplot(subset(diamonds, carat >= 2.2),
aes(x = table, y = price, colour = cut)) +
geom_point(alpha = 0.7) +
geom_smooth(method = "loess", alpha = 0.05, size = 1, span = 1) +
theme_bw()
p2 = ggplot(subset(diamonds, carat > 2.2 & depth > 55 & depth < 70),
aes(x = depth, fill = cut)) +
geom_histogram(colour = "black", binwidth = 1, position = "dodge") +
theme_bw()
加载配色：
## Lancet
p1_lancet = p1 + scale_color_lancet()
p2_lancet = p2 + scale_fill_lancet()
grid.arrange(p1_lancet, p2_lancet, ncol = 2)
其实除了Lancet，四大期刊的其他期刊NEJM, JAMA, BMJ都有浓浓的“癖好“”。
比如，NEJM，总是喜欢大红大紫。
再比如JAMA，直接就给出了样板图，有点小清新的感觉。
BMJ好像一直走自己的蓝色系风格。
最后，感叹一下，ggsci的作者，俩位才会横溢的，年轻的，统计工作研究者也是中国人。
BTW， 要是作者能替广大医学工作者，倒腾齐四大期刊，再加上JACC， Circulation，什么的那可就太好啦。要不然，我们就得自己倒腾R了。
本文由公众号「统技思维」出品人--谷鸿秋授权转载！
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